2. 技能进阶

索引:

• 2.1. GROMACS概述
  • 2.1.1. GROMACS的文件
  • 2.1.2. GROMACS的力场
  • 2.1.3. 获取GROMACS力场文件
  • 2.1.4. GROMACS的工作流程
  • 2.1.5. GROMACS的结果分析方法
  • 2.1.6. 拓展阅读
• 2.2. LAMMPS概述
  • 2.2.1. LAMMPS的命令
  • 2.2.2. LAMMPS输入脚本
  • 2.2.3. 拓展阅读
• 2.3. AMBER概述
  • 2.3.1. Amber programs
  • 2.3.2. Amber Force Fields
  • 2.3.3. Amber的文件
  • 2.3.4. Amber的力场
  • 2.3.5. 拓展阅读
• 2.4. CHARMM概述
  • 2.4.1. CHARMM力场
• 2.5. GLYCAM力场
  • 2.5.1. GLYCAM糖类命名规则
  • 2.5.2. 拓展阅读
• 2.6. Conda入门
  • 2.6.1. 安装Miniconda
  • 2.6.2. conda常见命令
• 2.7. VScode入门
  • 2.7.1. 为什么使用VScode
  • 2.7.2. vscode的插件
• 2.8. AutoDock Suite
  • 2.8.1. Getting Started
  • 2.8.2. 操作步骤
• 2.9. Cellulose-Builder
  • 2.9.1. 简介
  • 2.9.2. 软件依赖
  • 2.9.3. 解压安装
  • 2.9.4. 使用命令
  • 2.9.5. 输出
  • 2.9.6. 自定义
  • 2.9.7. 拓展阅读